Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01822 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01822 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01822 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01822 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
P01822 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01822 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01822 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01822 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01822 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
P01822 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01822 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01822 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01822 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01822 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01822 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01822 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01822 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01822 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01822 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01822 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01822 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01822 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01822 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01822 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01822 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01822 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01822 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
P01822 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
P01822 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
P01822 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01822 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
P01822 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01822 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01822 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01822 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
P01822 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01822 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01822 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01822 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01822 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01822 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01822 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01822 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01822 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01822 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01822 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01822 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01822 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01822 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01822 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01822 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P01822 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01822 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01822 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01822 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01822 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01822 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01822 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
P01822 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01822 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01822 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P01822 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P01822 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01822 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
P01822 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P01822 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01822 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01822 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01822 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01822 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01822 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01822 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
P01822 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01822 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01822 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01822 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01822 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01822 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01822 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
P01822 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01822 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01822 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01822 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01822 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01822 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01822 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
P01822 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01822 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01822 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01822 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01822 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01822 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01822 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01822 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01822 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01822 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01822 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01822 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01822 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 335.9 ms