Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctnnal1O88327 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnnal1O88327 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnnal1O88327 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnnal1O88327 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnnal1O88327 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnnal1O88327 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctnnal1O88327 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctnnal1O88327 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctnnal1O88327 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnnal1O88327 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnnal1O88327 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnnal1O88327 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnnal1O88327 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnnal1O88327 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnnal1O88327 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnnal1O88327 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnnal1O88327 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnnal1O88327 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnnal1O88327 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnnal1O88327 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnnal1O88327 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnnal1O88327 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnnal1O88327 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnnal1O88327 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnnal1O88327 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnnal1O88327 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnnal1O88327 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctnnal1O88327 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnnal1O88327 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnnal1O88327 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnnal1O88327 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctnnal1O88327 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctnnal1O88327 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctnnal1O88327 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnnal1O88327 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnnal1O88327 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnnal1O88327 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnnal1O88327 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms