Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorl1O88307 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorl1O88307 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sorl1O88307 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sorl1O88307 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorl1O88307 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorl1O88307 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sorl1O88307 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sorl1O88307 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorl1O88307 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorl1O88307 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorl1O88307 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorl1O88307 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorl1O88307 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorl1O88307 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorl1O88307 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms