Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FiglaO55208 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FiglaO55208 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FiglaO55208 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FiglaO55208 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FiglaO55208 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FiglaO55208 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FiglaO55208 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FiglaO55208 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FiglaO55208 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FiglaO55208 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FiglaO55208 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FiglaO55208 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FiglaO55208 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FiglaO55208 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FiglaO55208 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FiglaO55208 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FiglaO55208 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FiglaO55208 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FiglaO55208 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FiglaO55208 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FiglaO55208 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FiglaO55208 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FiglaO55208 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FiglaO55208 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FiglaO55208 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FiglaO55208 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FiglaO55208 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FiglaO55208 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FiglaO55208 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FiglaO55208 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FiglaO55208 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FiglaO55208 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FiglaO55208 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FiglaO55208 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FiglaO55208 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FiglaO55208 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FiglaO55208 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FiglaO55208 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FiglaO55208 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FiglaO55208 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FiglaO55208 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms