Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnk2O54967 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnk2O54967 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnk2O54967 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnk2O54967 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnk2O54967 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnk2O54967 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnk2O54967 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnk2O54967 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnk2O54967 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnk2O54967 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnk2O54967 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnk2O54967 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnk2O54967 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnk2O54967 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnk2O54967 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnk2O54967 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnk2O54967 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnk2O54967 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnk2O54967 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms