Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.5 ms