Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clcn6O35454 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn6O35454 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn6O35454 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms