Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc23O35125 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrrc23O35125 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc23O35125 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms