Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eftud2O08810 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eftud2O08810 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eftud2O08810 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eftud2O08810 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms