Protein–RNA interactions for Protein: O08791

Ebf3, Transcription factor COE3, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf3O08791 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ebf3O08791 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ebf3O08791 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ebf3O08791 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ebf3O08791 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ebf3O08791 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ebf3O08791 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ebf3O08791 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ebf3O08791 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ebf3O08791 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ebf3O08791 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ebf3O08791 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ebf3O08791 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ebf3O08791 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ebf3O08791 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ebf3O08791 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ebf3O08791 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ebf3O08791 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ebf3O08791 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ebf3O08791 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ebf3O08791 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ebf3O08791 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ebf3O08791 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ebf3O08791 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ebf3O08791 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ebf3O08791 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ebf3O08791 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ebf3O08791 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ebf3O08791 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ebf3O08791 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ebf3O08791 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ebf3O08791 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ebf3O08791 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ebf3O08791 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ebf3O08791 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ebf3O08791 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ebf3O08791 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ebf3O08791 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ebf3O08791 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ebf3O08791 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ebf3O08791 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ebf3O08791 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms