Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2al1oL7MU04 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2al1oL7MU04 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2al1oL7MU04 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2al1oL7MU04 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2al1oL7MU04 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2al1oL7MU04 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2al1oL7MU04 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2al1oL7MU04 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2al1oL7MU04 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
H2al1oL7MU04 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2al1oL7MU04 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2al1oL7MU04 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
H2al1oL7MU04 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2al1oL7MU04 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2al1oL7MU04 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms