Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smim22J3QP37 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smim22J3QP37 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smim22J3QP37 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smim22J3QP37 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smim22J3QP37 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smim22J3QP37 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smim22J3QP37 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smim22J3QP37 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smim22J3QP37 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smim22J3QP37 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smim22J3QP37 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smim22J3QP37 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smim22J3QP37 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smim22J3QP37 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smim22J3QP37 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smim22J3QP37 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smim22J3QP37 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smim22J3QP37 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smim22J3QP37 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smim22J3QP37 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smim22J3QP37 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Smim22J3QP37 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smim22J3QP37 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms