Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Pcf11G3X9Z4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Pcf11G3X9Z4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Pcf11G3X9Z4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Pcf11G3X9Z4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Pcf11G3X9Z4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Pcf11G3X9Z4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Pcf11G3X9Z4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Pcf11G3X9Z4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Pcf11G3X9Z4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Pcf11G3X9Z4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Pcf11G3X9Z4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Pcf11G3X9Z4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Pcf11G3X9Z4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Pcf11G3X9Z4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Pcf11G3X9Z4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Pcf11G3X9Z4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Pcf11G3X9Z4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Pcf11G3X9Z4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Pcf11G3X9Z4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Pcf11G3X9Z4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Pcf11G3X9Z4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Pcf11G3X9Z4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Pcf11G3X9Z4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Pcf11G3X9Z4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Pcf11G3X9Z4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Pcf11G3X9Z4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pcf11G3X9Z4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Pcf11G3X9Z4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Pcf11G3X9Z4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Pcf11G3X9Z4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Pcf11G3X9Z4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Pcf11G3X9Z4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Pcf11G3X9Z4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Pcf11G3X9Z4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Pcf11G3X9Z4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Pcf11G3X9Z4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Pcf11G3X9Z4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Pcf11G3X9Z4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Pcf11G3X9Z4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Pcf11G3X9Z4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Pcf11G3X9Z4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Pcf11G3X9Z4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Pcf11G3X9Z4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Pcf11G3X9Z4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pcf11G3X9Z4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pcf11G3X9Z4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Pcf11G3X9Z4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pcf11G3X9Z4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Pcf11G3X9Z4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Pcf11G3X9Z4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Pcf11G3X9Z4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Pcf11G3X9Z4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Pcf11G3X9Z4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Pcf11G3X9Z4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Pcf11G3X9Z4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Pcf11G3X9Z4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Pcf11G3X9Z4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Pcf11G3X9Z4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Pcf11G3X9Z4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Pcf11G3X9Z4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pcf11G3X9Z4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pcf11G3X9Z4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Pcf11G3X9Z4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Pcf11G3X9Z4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Pcf11G3X9Z4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Pcf11G3X9Z4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Pcf11G3X9Z4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Pcf11G3X9Z4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Pcf11G3X9Z4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pcf11G3X9Z4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
Pcf11G3X9Z4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Pcf11G3X9Z4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pcf11G3X9Z4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pcf11G3X9Z4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Pcf11G3X9Z4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Pcf11G3X9Z4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pcf11G3X9Z4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pcf11G3X9Z4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pcf11G3X9Z4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Pcf11G3X9Z4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Pcf11G3X9Z4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Pcf11G3X9Z4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Pcf11G3X9Z4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Pcf11G3X9Z4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms