Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Nkx1-1G3UXB3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nkx1-1G3UXB3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nkx1-1G3UXB3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nkx1-1G3UXB3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nkx1-1G3UXB3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nkx1-1G3UXB3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nkx1-1G3UXB3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nkx1-1G3UXB3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nkx1-1G3UXB3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nkx1-1G3UXB3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nkx1-1G3UXB3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nkx1-1G3UXB3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nkx1-1G3UXB3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nkx1-1G3UXB3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nkx1-1G3UXB3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nkx1-1G3UXB3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nkx1-1G3UXB3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nkx1-1G3UXB3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx1-1G3UXB3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx1-1G3UXB3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx1-1G3UXB3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx1-1G3UXB3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nkx1-1G3UXB3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nkx1-1G3UXB3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nkx1-1G3UXB3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nkx1-1G3UXB3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx1-1G3UXB3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Nkx1-1G3UXB3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nkx1-1G3UXB3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nkx1-1G3UXB3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.2 ms