Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd5G3UW60 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd5G3UW60 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd5G3UW60 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd5G3UW60 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd5G3UW60 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd5G3UW60 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd5G3UW60 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Susd5G3UW60 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd5G3UW60 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Susd5G3UW60 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Susd5G3UW60 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Susd5G3UW60 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Susd5G3UW60 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Susd5G3UW60 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Susd5G3UW60 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Susd5G3UW60 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Susd5G3UW60 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms