Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20538F6Z9R1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20538F6Z9R1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1172.4 ms