Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc71lE9Q4T4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms