Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1L0

Vmn2r80, Vomeronasal 2, receptor 80, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r80E9Q1L0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r80E9Q1L0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn2r80E9Q1L0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn2r80E9Q1L0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn2r80E9Q1L0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn2r80E9Q1L0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn2r80E9Q1L0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn2r80E9Q1L0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn2r80E9Q1L0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn2r80E9Q1L0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn2r80E9Q1L0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn2r80E9Q1L0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms