Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim30bE9PVL6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim30bE9PVL6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30bE9PVL6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30bE9PVL6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30bE9PVL6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim30bE9PVL6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim30bE9PVL6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30bE9PVL6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim30bE9PVL6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim30bE9PVL6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30bE9PVL6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30bE9PVL6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30bE9PVL6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim30bE9PVL6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim30bE9PVL6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30bE9PVL6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30bE9PVL6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30bE9PVL6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim30bE9PVL6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30bE9PVL6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30bE9PVL6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30bE9PVL6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30bE9PVL6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30bE9PVL6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30bE9PVL6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30bE9PVL6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30bE9PVL6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30bE9PVL6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30bE9PVL6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim30bE9PVL6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim30bE9PVL6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim30bE9PVL6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim30bE9PVL6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim30bE9PVL6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim30bE9PVL6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms