Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifit3bE9PV48 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifit3bE9PV48 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit3bE9PV48 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms