Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Syde2E9PUP1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Syde2E9PUP1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Syde2E9PUP1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Syde2E9PUP1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Syde2E9PUP1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Syde2E9PUP1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Syde2E9PUP1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Syde2E9PUP1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Syde2E9PUP1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Syde2E9PUP1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Syde2E9PUP1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Syde2E9PUP1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Syde2E9PUP1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Syde2E9PUP1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Syde2E9PUP1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Syde2E9PUP1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Syde2E9PUP1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Syde2E9PUP1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Syde2E9PUP1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Syde2E9PUP1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Syde2E9PUP1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Syde2E9PUP1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Syde2E9PUP1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Syde2E9PUP1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Syde2E9PUP1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Syde2E9PUP1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Syde2E9PUP1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Syde2E9PUP1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Syde2E9PUP1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Syde2E9PUP1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Syde2E9PUP1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Syde2E9PUP1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Syde2E9PUP1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Syde2E9PUP1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Syde2E9PUP1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Syde2E9PUP1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Syde2E9PUP1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Syde2E9PUP1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Syde2E9PUP1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Syde2E9PUP1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Syde2E9PUP1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Syde2E9PUP1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Syde2E9PUP1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Syde2E9PUP1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Syde2E9PUP1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Syde2E9PUP1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Syde2E9PUP1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Syde2E9PUP1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms