Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
4930444G20RikD3Z741 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930444G20RikD3Z741 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
4930444G20RikD3Z741 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930444G20RikD3Z741 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
4930444G20RikD3Z741 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930444G20RikD3Z741 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930444G20RikD3Z741 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
4930444G20RikD3Z741 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930444G20RikD3Z741 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930444G20RikD3Z741 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930444G20RikD3Z741 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930444G20RikD3Z741 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930444G20RikD3Z741 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930444G20RikD3Z741 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
4930444G20RikD3Z741 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930444G20RikD3Z741 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms