Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem200bD3Z0P8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmem200bD3Z0P8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem200bD3Z0P8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms