Protein–RNA interactions for Protein: B2RXS4

Plxnb2, Plexin-B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb2B2RXS4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plxnb2B2RXS4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Plxnb2B2RXS4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Plxnb2B2RXS4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Plxnb2B2RXS4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plxnb2B2RXS4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plxnb2B2RXS4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Plxnb2B2RXS4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Plxnb2B2RXS4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Plxnb2B2RXS4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Plxnb2B2RXS4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plxnb2B2RXS4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Plxnb2B2RXS4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plxnb2B2RXS4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plxnb2B2RXS4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plxnb2B2RXS4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Plxnb2B2RXS4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Plxnb2B2RXS4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Plxnb2B2RXS4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnb2B2RXS4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnb2B2RXS4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnb2B2RXS4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnb2B2RXS4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Plxnb2B2RXS4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Plxnb2B2RXS4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Plxnb2B2RXS4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Plxnb2B2RXS4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plxnb2B2RXS4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plxnb2B2RXS4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plxnb2B2RXS4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plxnb2B2RXS4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plxnb2B2RXS4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Plxnb2B2RXS4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Plxnb2B2RXS4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Plxnb2B2RXS4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Plxnb2B2RXS4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Plxnb2B2RXS4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Plxnb2B2RXS4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Plxnb2B2RXS4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plxnb2B2RXS4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plxnb2B2RXS4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Plxnb2B2RXS4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plxnb2B2RXS4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plxnb2B2RXS4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Plxnb2B2RXS4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plxnb2B2RXS4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plxnb2B2RXS4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plxnb2B2RXS4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plxnb2B2RXS4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms