Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cspp1B2RX88 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cspp1B2RX88 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cspp1B2RX88 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cspp1B2RX88 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cspp1B2RX88 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cspp1B2RX88 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cspp1B2RX88 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cspp1B2RX88 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cspp1B2RX88 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cspp1B2RX88 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cspp1B2RX88 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cspp1B2RX88 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cspp1B2RX88 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cspp1B2RX88 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cspp1B2RX88 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cspp1B2RX88 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.3 ms