Protein–RNA interactions for Protein: B1AQB1

Gm11569, Predicted gene 11569, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11569B1AQB1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm11569B1AQB1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm11569B1AQB1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms