Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl41A2AUC9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl41A2AUC9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl41A2AUC9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl41A2AUC9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl41A2AUC9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl41A2AUC9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl41A2AUC9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl41A2AUC9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl41A2AUC9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl41A2AUC9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl41A2AUC9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhl41A2AUC9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhl41A2AUC9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl41A2AUC9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl41A2AUC9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl41A2AUC9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhl41A2AUC9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl41A2AUC9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl41A2AUC9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl41A2AUC9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl41A2AUC9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl41A2AUC9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl41A2AUC9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl41A2AUC9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Klhl41A2AUC9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl41A2AUC9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl41A2AUC9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl41A2AUC9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl41A2AUC9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms