Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

Length 5,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmcn2A2AJ76 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmcn2A2AJ76 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmcn2A2AJ76 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hmcn2A2AJ76 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmcn2A2AJ76 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.5 ms