Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo47A2A6H3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo47A2A6H3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo47A2A6H3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo47A2A6H3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo47A2A6H3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo47A2A6H3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo47A2A6H3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo47A2A6H3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo47A2A6H3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo47A2A6H3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo47A2A6H3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo47A2A6H3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo47A2A6H3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo47A2A6H3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo47A2A6H3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo47A2A6H3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo47A2A6H3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fbxo47A2A6H3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms