Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms