Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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VAX2Q9UIW0 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAX2Q9UIW0 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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