Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms