Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms