Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 WDR92-202ENST00000406245 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CRISPLD1-202ENST00000517786 1964 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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ANKRD39Q53RE8 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 IGLV3-25-201ENST00000390305 380 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 IGHV1-2-201ENST00000390594 417 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL136380.2-201ENST00000411837 492 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC007179.2-205ENST00000412409 707 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZRANB2-AS2-203ENST00000415780 249 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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ANKRD39Q53RE8 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC012506.4-202ENST00000430051 572 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01468-202ENST00000435813 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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ANKRD39Q53RE8 AL137027.1-201ENST00000440358 444 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL161454.1-201ENST00000446226 569 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC074366.1-204ENST00000446277 552 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC005840.2-201ENST00000447193 355 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OR7E102P-201ENST00000448855 1015 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC245595.1-202ENST00000457390 425 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 GS1-24F4.2-202ENST00000531701 380 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC022880.2-201ENST00000532664 270 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC069235.1-202ENST00000545535 540 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CDRT8-201ENST00000579752 467 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC087393.3-201ENST00000584971 166 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 APOC2-202ENST00000585786 880 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC092723.1-201ENST00000599411 474 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MIR7156-201ENST00000620979 60 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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