Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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SIX1Q15475 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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SIX1Q15475 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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SIX1Q15475 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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SIX1Q15475 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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SIX1Q15475 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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SIX1Q15475 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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