Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCF4Q15080 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms