Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms