Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms