Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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