Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms