Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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