Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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TCOF1Q13428 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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TCOF1Q13428 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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TCOF1Q13428 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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TCOF1Q13428 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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TCOF1Q13428 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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TCOF1Q13428 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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TCOF1Q13428 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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TCOF1Q13428 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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TCOF1Q13428 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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