Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CEP290O15078 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CEP290O15078 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CEP290O15078 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CEP290O15078 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CEP290O15078 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CEP290O15078 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CEP290O15078 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CEP290O15078 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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CEP290O15078 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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CEP290O15078 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CEP290O15078 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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CEP290O15078 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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CEP290O15078 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CEP290O15078 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CEP290O15078 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CEP290O15078 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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CEP290O15078 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CEP290O15078 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CEP290O15078 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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CEP290O15078 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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CEP290O15078 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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CEP290O15078 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CEP290O15078 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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