Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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