Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms