Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms