Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms