Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms