Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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