Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r10W4VSP8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r10W4VSP8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms